Despues de haber instalado una JVM nueva hay que ejecutar en Ubuntu un comando para que actualize todos los paths default para poder ejecutar los programas con esa JVM.

Primero vamos a ejecutar el siguiente comando para ver las diferentes alternativas:

sudo update-java-alternatives -l

Quiza obtenemos un print como este:

root@gsovmfmsdev04:~# update-java-alternatives -l
java-6-sun 63 /usr/lib/jvm/java-6-sun
java-gcj 1042 /usr/lib/jvm/java-gcj

Ahora ejecutamos el comando set para utilizar nuestra alternativa deseada:

update-java-alternatives -s java-6-sun

Ahora podemos ver nuestra nueva version de esta manera:

java -version

Eso es todo